El cebiche se habría originado en la cultura Tallán (Piura). Asimismo, se sabe que los mochicas preparaban este plato sobre la base de pescado fresco que se maceraba con el tumbo, una fruta andina.
Algunas crónicas reportan que a lo largo de la costa peruana se consumía el pescado con sal y ají. Durante el Imperio incaico, el pescado era macerado con chicha.
Posteriormente, las mujeres moriscas que llegaron con los españoles le habrían añadido naranja agria y algas a este plato que llamaron “sibech” (“comida acida”, en árabe). A partir del siglo XX, se usó limón.